La comisión está presidida por el senador por Tierra del Fuego del interbloque Argentina Federal José Ojeda, secundado por el diputado por Cambiemos de la provincia de Buenos Aires, Guillermo Montenegro.
La comisión está conformada por seis diputados y seis senadores, de los cuales cuatro pertenecen al oficialismo y el resto a diferentes partidos de la oposición.
Por la Cámara alta integran la bicameral la riojana Olga Inés Brizuela y Doria (UCR), Esteban Bullrich, el chubutense Alfredo Luenzo (Chubut Somos Todos) y el fueguino Ojeda de Argentina Federal, Anabel Fernández Sagasti (FPV.PJ) y la rionegrina Magdalena Odarda, del Frente Progresista.
Por Diputados, forman parte de la comisión Guillermo Carmona y Nilda Garré (FPV-PJ) , el massista Alejandro Grandinetti, el justicialista Pedro Miranda, y los oficialistas Montenegro y Luis Petri.
El ARA San Juan se comunicó por última vez el 15 de noviembre mientras navegaba en el Atlántico Sur con 44 tripulantes a bordo. Había partido unos días antes de la austral ciudad de Ushuaia rumbo a su apostadero en la Base Naval Mar del Plata.